Formålet med vern av Fredriksvern verft er å ta være på et av de best bevarte militære anlegg fra barokktiden i Danmark-Norge. Verneplanens formål er å bidra til ivaretagelsen av de kvaliteter som tentativt er oppregnet under kap. 5.1 Kulturmiljøet. For å oppnå dette er det viktig at:
- området bevares og forvaltes som en helhet. Den visuelle og funksjonelle sammenhengen mellom ulike deler av miljøet må opprettholdes og styrkes.
- de fortifikatoriske anleggene bevares slik at deres utforming, funksjon og gjensidige sammenheng tydeliggjøres.
- bygninger, anlegg og fortifikasjoner forvaltes slik at deres opprinnelige preg og eldre bygningshistorie blir bevart. Dette innebærer bevaring av konstruksjoner, rominndeling, overflater, bygningselementer og arkitektoniske detaljer i henhold til vernebestemmelsene.
- vedlikehold og restaurering skjer etter antikvariske prinsipper.
- eventuelle tilbakeføringer gjøres i samråd med og etter godkjennelse av kulturminnemyndighet.
- tiltak i og skjøtsel av landskapet omkring anleggene søker å ivareta, evt. forbedre, virkningen av anleggene i landskapet, med respekt for de opprinnelige sammenhenger og de historiske prosesser som har funnet sted, samt respekt for biologisk mangfold. OPPLAGSHAVN. I landskapet på øyene utenfor verftet finnes en rekke mer eller mindre fragmenterte reminiscenser fra marinetiden. Midt i bildet sees en fortøyningsring på skjæret «Kulorten» i innseilingen til opplagshavnen på Stavernsøya. Foto: Hans Egede-Nissen